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Licenciado em Ciências Farmacêuticas, Doutorado e Agregado em Farmácia (Especialidade de Farmacologia) pela UC, é Professor Catedrático desde 2007.
Ao longo da sua carreira académica foi chamado a desempenhar vários cargos no âmbito da gestão universitária, como Diretor da Faculdade de Farmácia entre 2010 e 2012, Presidente do Conselho Pedagógico, Vice-Presidente e Presidente do Conselho Científico e ainda pelo governo da própria UC, onde foi membro do Senado, Conselho Geral (2008-2010) e do Conselho de Gestão (2015-2017).  Vice-Reitor da UC para a Investigação, Inovação, Empreendedorismo e Desporto (2011-2019) e Diretor do Instituto de Investigação Interdisciplinar (IIIUC), função que desempenha desde (2013-2019). É, ainda, Director Técnico da empresa ICNAS Produção (empresa detida a 100% pela Universidade de Coimbra)..

Investigador e líder do Grupo de Farmacometria do Centro de Neurociências e Biologia Celular (CNC) da UC, é autor e co-autor de algumas centenas de comunicações e publicações científicas. Possuindo vários projetos de investigação fundamental e aplicada em execução, destaca-se o facto da maioria do seu financiamento ser suportado por empresas nacionais e multinacionais do ramo farmacêutico. A sua atividade científica tem-lhe valido vários prémios ao longo do seu percurso profissional, sendo de destacar o de “Eminent Sicentist of the Year – Clinical Pharmacology” (2006) e o “Prémio Almofariz – Figura do Ano” (2008).
Esteve diretamente envolvido no programa de desenvolvimento do primeiro medicamento português (Acetato de Eslicarbazepina – Zebinix®) como consultor dos Laboratórios BIAL.

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Ernesto Jorge Fernandes Costa é Professor Catedrático do Departamento de Engenharia Informática (DEI) da Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade de Coimbra (FCTUC), onde concluiu a licenciatura em 1976. Foi co-fundador e primeiro presidente eleito do DEI, entre 1997 e 1999, e presidente da Comissão Científica do DEI, entre 2006 e 2008. Obteve o doutoramento de Terceiro Ciclo, em Informática Teórica, pela Universidade de Paris VI, em 1981, e o doutoramento em Engenharia Electrotécnica, na FCTUC, em 1985.
As suas áreas principais de investigação são a Inteligência Artificial, a Vida Artificial, os Sistemas Complexos, a Cognição e a Biologia Computacional. Foi co-fundador do Centro de Informática e Sistemas da Universidade de Coimbra (CISUC), seu presidente entre 1998 e 2000. Fundou e liderou o Grupo de Inteligência Artificial, em 1986, que abandonou, em 2003, para criar e liderar o Grupo de Computação Evolucionária e Sistemas Complexos, a que actualmente pertence.
Participou em vários projectos nacionais e internacionais, tendo ganho quatro prémios de melhor trabalho científico em eventos científicos internacionais. Em 2009 foi-lhe atribuído o 2009 Evostar Award for Outstanding contributions to the Field of Evolutionary Computation, prémio de consagração de carreira. Organizou diversos eventos científicos, tendo publicado mais de 150 trabalhos em livros, revistas e actas de conferências.

Nascido em Coimbra em 1953, Ernesto Costa foi orientador de diversos alunos de mestrado e de doutoramento, em Portugal e no estrangeiro. A pedido da UNESCO, organizou e coordenou atividades de formação em informática em países de língua oficial portuguesa (Cabo Verde e São Tomé e Príncipe), tendo ainda participado no projeto de formação EDDI para os primeiros engenheiros informáticos da Universidade Agostinho Neto, em Angola. Em 2013, integrou a equipa criada pela Fundação das Universidades Portuguesas que trabalhou na reorganização da Universidade Nacional de Timor Lorosae.

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Professor na Faculdade de Letras da Universidade de Coimbra desde 1986, onde tem lecionado disciplinas de História Moderna de Portugal, Cultura Portuguesa e seminários de pós-graduação sobre a Inquisição.

Preparou o seu doutoramento no Instituto Universitário Europeu (Florença), pelo que, desde cedo, tem manifestado preocupações com a História comparada

É investigador do Centro de História da Sociedade e da Cultura da Universidade de Coimbra, do Centro de Estudos de História Religiosa da Universidade Católica Portuguesa e académico correspondente da Academia Portuguesa da História.

Desde 2005, integrou a comissão científica internacional que coordenou a elaboração do Dizionario Storico dell´Inquisizione (Pisa, 2010) e é o coordenador científico dos Portugaliae Monumenta Misericordiarum (8 vols. editados).

É autor de Práticas e crenças mágicas. O medo e a necessidade dos mágicos na diocese de Coimbra (1650-1740), (Coimbra, 1992), Bruxaria e superstição num país sem caça às bruxas: 1600-1774, (Lisboa, 1997 e 2002), Religious ceremonials and images: power and social meaning (1400-1750), (Coimbra, 2002) e de vários capítulos da História Religiosa de Portugal (Lisboa, 2000). Na Imprensa da Universidade de Coimbra publicou o seu último livro Os bispos de Portugal e do Império (1495-1777) (Coimbra, 2006).